宮古島マリンリゾート協同組合はダイビングを通じて、自然環境保護や宮古島の観光イベントに協力しています。
平成２０年２月より宮古地区三漁業協同組合と協定し「美ら海連絡協議会」を設立。ダイビングポイントにブイを設置や、珊瑚礁の保護に務めています。